Описание

Впервые были проанализированы данные Hi-C эксперимента для различных типов клеток G. gallus, а также сравнены топологически ассоциированные домены млекопитающих в полногогеномном масштабе. Полученные результаты позволили выявить черты организации хроматина, уникальные для G. gallus и  резко отличающие ее от млекопитающих. Получены новые данные по архитектуре хроматина пяти видов комаров рода Anopheles. Впервые было проведено межвидовое сравнение архитектура хроматина для указанной таксономической группы. Данные результаты будут использованы в дальнейшем для изучения генетики этих организмов. Разработанный биоинформатический метод сравнивания архитектуры хроматина на отдельных контактах является первым подобным методом такого рода, реализованный в виде пакета программ C-InterSecture. Изучена проблема математического определения эволюционной консервативности пространственной организации хроматина. Использование пакета программ C-INterSecture представляет перспективный способ изучения механизмов эволюционной экспрессии, регулирования генной экспрессии, прояснения взаимосвязей известных мутаций с хромосомными перестройками, а также фенотипических проявлениями.
Результаты работы вошли в отчёты по Грантам Президента России, Российского Научного Фонда, Российского Фонда Фундаментальных Исследований. Результаты работы доложены на 4-х конференциях в виде 3-х устных  докладов. Разработанный алгоритм для сравнения структуры хроматина на индивидуальных контактах находится в открытом доступе. Основные результаты, изложенные в диссертации, были получены лично соискателем: разработан биоинформатический алгоритм сравнения архитектуры хроматина, их апробация с использованием результатов HiC-экспериментов. Экспериментальные данные Hi-C для G. gallu предоставил канд. биол. наук Баттулин Н.Р., для комаров Anopheles — др. биол. наук Шараховым И.В., Лукьянчиковой В.А.