РНИМУ им. Н.И. Пирогова имеет 4 корпуса общежития на 3280 койко/мест, используемых для проживания иногородних обучающихся. Иногородними признаются лица, имеющие постоянную регистрацию за пределами 5-й зоны Московской железной дороги.

Проживающие в общежитии обязаны соблюдать установленные правила проживания, своевременно вносить плату за проживание.